Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMC1AQ14683 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC1AQ14683 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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