Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms