Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms