Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf61Q13536 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms