Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTA1Q13330 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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