Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGDRQ13258 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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