Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME3Q13232 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NME3Q13232 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME3Q13232 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME3Q13232 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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