Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RESTQ13127 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RESTQ13127 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RESTQ13127 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RESTQ13127 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RESTQ13127 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RESTQ13127 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RESTQ13127 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RESTQ13127 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RESTQ13127 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RESTQ13127 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RESTQ13127 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RESTQ13127 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RESTQ13127 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RESTQ13127 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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