Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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