Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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FOXC1Q12948 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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FOXC1Q12948 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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FOXC1Q12948 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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