Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF1Q12946 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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