Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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