Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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