Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms