Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPAL4Q0D2K0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms