Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms