Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN3Q08043 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms