Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3AQ05086 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms