Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms