Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms