Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB1Q02818 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB1Q02818 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms