Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF8Q02556 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms