Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A3Q01959 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms