Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms