Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms