Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK16Q00536 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms