Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD1P98174 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD1P98174 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD1P98174 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD1P98174 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD1P98174 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD1P98174 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD1P98174 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD1P98174 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD1P98174 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD1P98174 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms