Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-24P63145 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms