Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERVK_113P61574 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERVK_113P61574 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms