Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP9P55211 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP9P55211 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP9P55211 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP9P55211 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP9P55211 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP9P55211 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP9P55211 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP9P55211 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP9P55211 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP9P55211 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP9P55211 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP9P55211 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP9P55211 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP9P55211 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP9P55211 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms