Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms