Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIF1P55008 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIF1P55008 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AIF1P55008 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AIF1P55008 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIF1P55008 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIF1P55008 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIF1P55008 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms