Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP1P54849 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP1P54849 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP1P54849 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms