Protein–RNA interactions for Protein: P54070

KTR6, Mannosyltransferase KTR6, yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR6	P54070	ACM1	YPL267W	630 nt		2.59	□□□□□ -1.99
KTR6	P54070	YBP2	YGL060W	1926 nt		2.59	□□□□□ -1.99
KTR6	P54070	BOI1	YBL085W	2943 nt		2.59	□□□□□ -1.99
KTR6	P54070	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.59	□□□□□ -2
KTR6	P54070	AVT5	YBL089W	1380 nt		2.59	□□□□□ -2
KTR6	P54070	CSF1	YLR087C	8877 nt		2.59	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YKU80	YMR106C	1890 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	AEP1	YMR064W	1557 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YDR381C-A	YDR381C-A	345 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YIL046W-A	YIL046W-A	165 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YOR050C	YOR050C	348 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	DPB3	YBR278W	606 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RLI1	YDR091C	1827 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.58	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.57	□□□□□ -2
KTR6	P54070	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.57	□□□□□ -2
KTR6	P54070	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.57	□□□□□ -2
KTR6	P54070	FMN1	YDR236C	657 nt		2.57	□□□□□ -2
KTR6	P54070	AIM19	YIL087C	474 nt		2.57	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		2.57	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YPR147C	YPR147C	915 nt		2.57	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YCL002C	YCL002C	792 nt		2.57	□□□□□ -2
KTR6	P54070	SLN1	YIL147C	3663 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	LOC1	YFR001W	615 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	PGD1	YGL025C	1194 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	LIN1	YHR156C	1023 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	CDC123	YLR215C	1083 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RPL6B	YLR448W	531 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	IRC21	YMR073C	606 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YOL114C	YOL114C	609 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	LTP1	YPR073C	486 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	CDC37	YDR168W	1521 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YBL005W-B	YBL005W-B	5268 nt		2.56	□□□□□ -2
KTR6	P54070	VAC14	YLR386W	2643 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RAV2	YDR202C	1056 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	FIR1	YER032W	2631 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	SNO3	YFL060C	669 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YGL039W	YGL039W	1047 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	MND1	YGL183C	660 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	COG2	YGR120C	789 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	SNO2	YNL334C	669 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	TSR4	YOL022C	1227 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	HSP10	YOR020C	321 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	snR35	snR35	204 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	ARL1	YBR164C	552 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YCL007C	YCL007C	393 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	ADF1	YCL058W-A	342 nt		2.55	□□□□□ -2
KTR6	P54070	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	GCV2	YMR189W	3105 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RSM28	YDR494W	1086 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	TAD1	YGL243W	1203 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YJL133C-A	YJL133C-A	225 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RPA12	YJR063W	378 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YKL069W	YKL069W	543 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	MCR1	YKL150W	909 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RPS1A	YLR441C	768 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YOL134C	YOL134C	390 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	GCY1	YOR120W	939 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	NAB6	YML117W	3405 nt		2.54	□□□□□ -2
KTR6	P54070	CST9	YLR394W	1449 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	snR68	snR68	136 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YDL163W	YDL163W	303 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YDR248C	YDR248C	582 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	HYP2	YEL034W	474 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YFH7	YFR007W	1062 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	MST27	YGL051W	705 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	OTU2	YHL013C	924 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YIL156W-B	YIL156W-B	222 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	TPK3	YKL166C	1197 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YKE2	YLR200W	345 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YLR257W	YLR257W	966 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	GRE2	YOL151W	1029 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	YOR277C	YOR277C	309 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	LCL1	YPL056C	306 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	Q0017	Q0017	162 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	RIM13	YMR154C	2184 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	SRP1	YNL189W	1629 nt		2.53	□□□□□ -2
KTR6	P54070	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.52	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	POL4	YCR014C	1749 nt		2.52	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	HLR1	YDR528W	1272 nt		2.52	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	YKL070W	YKL070W	510 nt		2.52	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	ATG10	YLL042C	504 nt		2.52	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	SGM1	YJR134C	2124 nt		2.51	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	YOL057W	YOL057W	2136 nt		2.51	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	YIP1	YGR172C	747 nt		2.51	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	DSE2	YHR143W	978 nt		2.51	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	YAP5	YIR018W	738 nt		2.51	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	YJL169W	YJL169W	369 nt		2.51	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	BUD19	YJL188C	309 nt		2.51	□□□□□ -2.01
KTR6	P54070	YET1	YKL065C	621 nt		2.51	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.6 ms