Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms