Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAMP50895 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAMP50895 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAMP50895 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAMP50895 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAMP50895 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAMP50895 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAMP50895 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAMP50895 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCAMP50895 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCAMP50895 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCAMP50895 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCAMP50895 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCAMP50895 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAMP50895 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAMP50895 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms