Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms