Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK8P49336 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK8P49336 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK8P49336 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK8P49336 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK8P49336 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK8P49336 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK8P49336 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK8P49336 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK8P49336 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms