Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMAN1P49257 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms