Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF4P48230 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms