Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD4P46934 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4P46934 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms