Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms