Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms