Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDF5P43026 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDF5P43026 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDF5P43026 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDF5P43026 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF5P43026 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms