Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms