Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA2P42262 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA2P42262 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA2P42262 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA2P42262 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA2P42262 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA2P42262 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms