Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NF2P35240 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NF2P35240 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NF2P35240 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NF2P35240 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF2P35240 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NF2P35240 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NF2P35240 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NF2P35240 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NF2P35240 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms