Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN7P35236 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms