Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP6P35125 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP6P35125 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP6P35125 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP6P35125 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP6P35125 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP6P35125 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6P35125 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6P35125 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP6P35125 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP6P35125 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP6P35125 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP6P35125 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP6P35125 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP6P35125 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP6P35125 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP6P35125 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP6P35125 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP6P35125 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP6P35125 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms