Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFNP31947 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFNP31947 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFNP31947 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFNP31947 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFNP31947 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFNP31947 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFNP31947 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFNP31947 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFNP31947 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFNP31947 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFNP31947 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms